烘焙過的咖啡豆，很容易受到空氣中的氧氣產生氧化作用，使得所含的油質劣化，芳香為亦揮發消失，再經過溫度、濕度、日光等而加速變質。 尤其是經過多層處理的低因咖啡豆，氧化作用進行的更快。因此，為了維持咖啡的香味和品質，如何包裝儲存咖啡豆就成了一門大學問。　咖啡豆在烘焙過後會產生出相當於體積三倍的二氧化碳，因此，咖啡的包裝最主要除了避免與空氣接觸氧化外，還有需處理咖啡豆產生的二氧化碳。

　真空包裝

包裝容器(罐、鋁箔袋、膠袋)在填充咖啡後，將容器內的空氣抽出。雖名為真空，但事實上頂多去除了百分之九十的空氣，且咖啡粉的面積比咖啡豆的表面積大，即使是剩下的一點空氣，也很容易地與粉末結合而影響風味。

含氣包裝

　　最普通的包裝，用空罐、玻璃、紙袋或塑料容器來包裝豆子、粉末，再加蓋或加封包裝。儲存性低，且因無時無刻與空氣接觸，需盡快飲用，飲用期間為一周左右。　

瓦斯填充包裝

　　在金屬袋上設計一個針孔，在填充咖啡後，將非活性的氮氣灌入，把袋內的二氧化碳字針孔擠壓出去。此法較為普及，但所有的氣體被排出後，氧氣就無聲無息地從針孔反鑽入袋內了。瓦斯吸著劑包裝 將由脫氧素、脫碳素所制成的吸著劑放入包裝袋中，包裝內的空氣可輕易地吸收，且咖啡所產生的碳酸氣亦能吸入，但咖啡的香氣也會被吸走是其缺點。

UCC亞羅馬包裝

　　為目前最理想的咖啡外包裝，全部皆以豆子的型態而非粉末型態來包裝。它和針孔金屬袋類似，不同的是在袋內的氣體可經由針孔排出，而單向活塞可使袋外的氧氣無法進入袋內。咖啡廠商在豆子烘焙好後立刻將豆子冷卻包裝，並將氮氣灌入袋內，已排出袋內氣體。這種包裝法雖為理想，但材料貴、成本高，目前只有大公司的精選咖啡會採用這種包裝法。